The first thing you will need to do when you begin using Jmol is to make sure that it is running. To do this, just right-click on the program icon or hold the mouse button down to open the menu. On Windows, you can open the menu by selecting the command "View->Jmol Menu." On Mac, you can choose "View->Menu JMOL e Selecione o console. O console exibe uma lista de configurações disponíveis e o submenu de exibição fornece uma variedade de opções de cores.
Se você não quiser passar pelo processo de download, você também pode acessar a lista de discussão JMOL, que tem todas as mensagens da comunidade. A lista de discussão da JMOL é destinada às comunidades de pesquisa e educação, mas também está aberta a qualquer pessoa interessada em contribuir com código ou enviar patches. Enquanto a lista de discussão do JMOL-Users é especificamente para os usuários, a lista de desenvolvedores JMOL é para desenvolvedores. A equipe de desenvolvimento da JMOL mantém uma lista separada para os usuários.
Depois de instalar o aplicativo, você pode abri-lo com o comando executar JMOL. O programa será executado automaticamente no seu computador. Para acessá-lo, abra o ambiente de design do usuário JMOL (Jude) e insira o nome do arquivo do banco de dados de proteína. Depois que a instalação estiver concluída, a JMOL será aberta em uma nova janela. Depois, você pode interagir com a molécula pressionando o botão direito do clique.
